Mathias Abegg studierte Medizin an den Universitäten Zürich und Lausanne und hat einen PhD in Neuroscience der Universität Zürich. Er absolvierte Weiterbildungen im Bereich Ophthalmologie in Zürich und Bern und nahm an Fellowship-Programmen in Schielchirurgie in Holland sowie in Neuroophtalmologie in Kanada teil. Bis 2022 war Mathias Abegg leitender Arzt Orthoptik an der Universitätsklinik für Augenheilkunde im Inselspital Bern und gründete im gleichen Jahr die ONOVIS Augenpraxis. Seit 2020 ist er zudem Mitgründer und ärztlicher Direktor von machineMD, einem Unternehmen, das auf die Messung von Hirnfunktionen spezialisiert ist.